תחום איכות הסביבה המתפתח והדרישות הרגולטוריות לעמידה ביעדים ברי קיימא יוצרים דרישה מוגברת מצד התעשייה, תאגידי המים והרשויות המקומיות לביצוע בדיקות מעבדה. המעבדה מלווה פרויקטים בתחום איכות הסביבה, כגון אנליזה של מים מאיכויות שונות כמו מי שפכים, מי קולחין, מי תהום, מי מאגרים, מי נגר מכבישים ועוד.
המעבדה מוסמכת בתקן בינלאומי ISO17025 על ידי הרשות הלאומית להסמכת מעבדות לבדיקות אלו משנת 2006. בדיקות שפכים וקולחין מוכרות על ידי משרד הבריאות
מעבדת השירות מבצעת בדיקות מקיפות ומלאות בתחום השפכים, הקולחין והבוצות, כמו גם ביצוע דיגום באמצעות דוגמים מוסמכים על ידי משרד הבריאות וניידות דיגום מאובזרות.